Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17654F7AXR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms