Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms