Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms