Protein–RNA interactions for Protein: F6SVV1

Gm9493, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9493F6SVV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm9493F6SVV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm9493F6SVV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms