Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl3d2F6R3P9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms