Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4E9QAP7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms