Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cald1E9QA15 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cald1E9QA15 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms