Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc74aE9Q9U8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms