Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrdnE9Q9K5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrdnE9Q9K5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms