Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc146E9Q9F7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms