Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Urb2E9Q7L1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Urb2E9Q7L1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms