Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdc1E9Q5K9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdc1E9Q5K9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms