Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd2E9Q5F9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms