Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A2

Gm38392, Predicted gene, 38392 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm38392E9Q2A2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm38392E9Q2A2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm38392E9Q2A2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm38392E9Q2A2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms