Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Zfp558E9Q1J0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Zfp558E9Q1J0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Zfp558E9Q1J0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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Zfp558E9Q1J0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Zfp558E9Q1J0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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