Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt78E9Q0F0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt78E9Q0F0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms