Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm9972E9Q053 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm9972E9Q053 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm9972E9Q053 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms