Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcom1E9PZ54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms