Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd1E9PZ26 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd1E9PZ26 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms