Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf2E9PXF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms