Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2956E9PVJ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2956E9PVJ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms