Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc62E9PVD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms