Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc175E9PVB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms