Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim5E9PV98 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim5E9PV98 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms