Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde2E9PUP1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms