Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cngb1E1AZ71 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cngb1E1AZ71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms