Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930595D18RikD3Z642 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930595D18RikD3Z642 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930595D18RikD3Z642 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930595D18RikD3Z642 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930595D18RikD3Z642 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms