Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
4930407I10RikD3Z5T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms