Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms