Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
3425401B19RikD3Z1D3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
3425401B19RikD3Z1D3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
3425401B19RikD3Z1D3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms