Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed7D3YZZ5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms