Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm42791D3YYB5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm42791D3YYB5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms