Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kif28pD3YXS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif28pD3YXS5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms