Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd1D3YXK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.2 ms