Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms