Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rexo5D3YW29 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo5D3YW29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms