Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap70D3YVL2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap70D3YVL2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap70D3YVL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms