Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptprz1B9EKR1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptprz1B9EKR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptprz1B9EKR1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms