Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia1B2RXQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms