Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp26c1B2RXA7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp26c1B2RXA7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms