Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfap58B2RW38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms