Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700018F24RikB2RW27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700018F24RikB2RW27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms