Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud7bB2RUR8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud7bB2RUR8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms