Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usf3B2RUQ2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms