Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU015836B2RUM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU015836B2RUM3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms