Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrn3B2RS91 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrn3B2RS91 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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