Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JrklB2RRL2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrklB2RRL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrklB2RRL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms