Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plekhd1B2RPU2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plekhd1B2RPU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plekhd1B2RPU2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms