Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd5B1AYB6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mbd5B1AYB6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd5B1AYB6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms