Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trabd2bB1ATG9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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